Dersi Veren Fakülte \ Bölüm
Mühendislik Fakültesi \ Biyomedikal Mühendisliği
Kredi
AKTS
Ders Türü
Öğretim Dili
Bu dersin önkoşulu bulunmamaktadır.
Biyomedikal Mühendisliği Bölümü
BMM 310 dersi Biyomedikal Mühendisliği üçüncü sınıf öğrencilerine hesaplamalı biyo(nano)teknoloji ve malzeme teorisi konularındaki temel ve uygulamalı çalışmalar üzerinde durulur.
Ders Kitapları ve/veya Kaynaklar
• Advanced Engineering Mathematics, P.V. O'Neil, PWS Publishing Company, 2002.
• Numerical Solution of Partial Differential Equations: An Introduction, K.W. Morton and D.F. Mayers, Cambridge University Press, 2005.
• An Introduction to Numerical Analysis, E. Suli and D. Mayers, Cambridge University Press, 2003.
• Güncel Makaleler
BMM 310 dersinin amacı genel olarak sayısal yöntemler ve algoritmalar hakkında bilgi verilerek, difüzyon, biyoenformatik, moleküler dinamik, homoloji modellemesi gibi güncel programlar hakkında uygulamalı bilgi vererek öğrencilerin bu çok hızlı gelişen alana uyum sağlamalarını amaçlanmıştır. Bu ders özellikle temel algoritma yazma/yorumlama teknikleri ile proteinlerin yapı modellemeleri konularına yoğunlaşacaktır.
1. sayısal yöntemler hakkında genel bilgiye sahip olması;
2. Başlangıç-sınır-değer problemlerinin sayısal çözümü için sonlu fark yöntemleri kurması;
3. Moleküler dinamik uygulama alanları hakkında bilgi sahibi olması;
4. Biyoenformatik uygulama alanları hakkında genel bilgi sahibi olunması
5. Protein yapı tahmini için mühendislik ve matematiksel yöntemleri uygulayabilmesi.
6. İlgili konuları araştırma, rapor yazma ve sunma becerisi kazanması.
1. Hafta: Temel Programlama ve Algoritmalar
2. Hafta: Matris İşlemleri ve Kök Bulma
3. Hafta: Matris İşlemleri ve Sayısal Entegrasyon
4. Hafta: Adi Diferansiyel Denklemler için Sayısal Yöntemler / Uygulamalar
5. Hafta: Kısmi Diferansiyel Denklemler için Sayısal Yöntemler / Uygulamalar
6. Hafta: Kısmi Diferansiyel Denklemler için Sayısal Yöntemler / Uygulamalar
7. Hafta: Protein Yapı Tahmini / Moleküler Dinamik
8. Hafta: Protein Yapı Tahmini / Moleküler Dinamik
9. Hafta: Biyoinformatik
10. Hafta: Biyoinformatik
11. Hafta: Homoloji Modellemesi
12. Hafta: Homoloji Modellemesi / Uygulamalar
Referans Değerlendime Ölçütleri
• Ara Sınav % 25
• Final % 35
• Kısa Sınav % 25
• Proje % 15
|
Program Çıktısı
*
|
| 1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
6 |
7 |
8 |
9 |
10 |
11 |
|
Ders Çıktısı
|
|---|
| 1 |
|
|
|
|
|
B
|
A
|
B, A
|
B, A
|
|
|
| 2 |
B, A
|
B, A
|
|
A
|
|
B
|
A
|
A, B
|
B
|
|
|
| 3 |
B, A
|
B, A
|
|
A
|
|
B
|
A
|
B, A
|
B
|
|
|
| 4 |
B, A
|
A, B
|
|
A
|
|
B
|
A
|
A, B
|
B
|
|
|
| 5 |
B, A
|
B, A
|
B
|
A
|
|
B
|
A
|
B, A
|
B
|
|
|
| 6 |
|
|
|
|
|
B
|
B, A, C
|
A, B
|
|
|
|