Dersi Veren Fakülte \ Bölüm
Mühendislik Fakültesi \ Biyomedikal Mühendisliği
Kredi
AKTS
Ders Türü
Öğretim Dili
Biyomedikal Mühendisliği Bölümü
BMM 310 dersi Biyomedikal Mühendisliği üçüncü sınıf öğrencilerine hesaplamalı biyo(nano)teknoloji ve malzeme teorisi konularındaki temel ve uygulamalı çalışmalar üzerinde durulur.
Ders Kitapları ve/veya Kaynaklar
• Advanced Engineering Mathematics, P.V. O'Neil, PWS Publishing Company, 2002.
• Numerical Solution of Partial Differential Equations: An Introduction, K.W. Morton and D.F. Mayers, Cambridge University Press, 2005.
• An Introduction to Numerical Analysis, E. Suli and D. Mayers, Cambridge University Press, 2003.
• Güncel Makaleler
BMM 310 dersinin amacı genel olarak sayısal yöntemler ve algoritmalar hakkında bilgi verilerek, difüzyon, biyoenformatik, moleküler dinamik, homoloji modellemesi gibi güncel programlar hakkında uygulamalı bilgi vererek öğrencilerin bu çok hızlı gelişen alana uyum sağlamalarını amaçlanmıştır. Bu ders özellikle temel algoritma yazma/yorumlama teknikleri ile proteinlerin yapı modellemeleri konularına yoğunlaşacaktır.
1. sayısal yöntemler hakkında genel bilgiye sahip olması;
2. Başlangıç-sınır-değer problemlerinin sayısal çözümü için sonlu fark yöntemleri kurması;
3. Moleküler dinamik uygulama alanları hakkında bilgi sahibi olması;
4. Biyoenformatik uygulama alanları hakkında genel bilgi sahibi olunması
5. Protein yapı tahmini için mühendislik ve matematiksel yöntemleri biyolojik sınırlamaları gözeterek uygulayabilmesi.
6. İlgili konuları araştırma, rapor yazma ve sunma becerisi kazanması.
1. Hafta Temel Programlama ve Algoritmalar
2. Hafta Matris İşlemleri ve Kök Bulma
3. Hafta Matris İşlemleri ve Sayısal Entegrasyon
4. Hafta Adi Diferansiyel Denklemler için Sayısal Yöntemler / Uygulamalar
5. Hafta Kısmi Diferansiyel Denklemler için Sayısal Yöntemler / Uygulamalar
6. Hafta Kısmi Diferansiyel Denklemler için Sayısal Yöntemler / Uygulamalar
7. Hafta Protein Yapı Tahmini / Moleküler Dinamik
8. Hafta Protein Yapı Tahmini / Moleküler Dinamik
9. Hafta Biyoinformatik
10. Hafta Biyoinformatik
11. Hafta Homoloji Modellemesi
12. Hafta Homoloji Modellemesi / Uygulamalar
| Referans Değerlendirme Ölçütleri |
| Etkinlikler |
Sayısı |
Katkı Payı (%) |
| Derse Devam / Katılım |
- |
- |
| Laboratuvar |
- |
- |
| Uygulama |
- |
- |
| Ödev |
- |
- |
| Proje |
1 |
%8 |
| Sunum / Sözlü Sınav |
1 |
%7 |
| Alan Çalışması |
- |
- |
| Staj |
- |
- |
| Kurul |
- |
- |
| Kısa Sınav (Quiz) |
5 |
%25 |
| Ara Sınav |
1 |
%25 |
| Final |
1 |
%35 |
|
Toplam |
%100 |
| Referans AKTS-İş Yükü Tablosu |
| Etkinlikler |
Sayısı/Hafta |
Süresi (Saat) |
İş Yükü |
| Ders Süresi (ilk 6 hafta) |
6 |
4 |
24 |
| Ders Süresi (son 6 hafta) |
6 |
3 |
18 |
| Laboratuvar |
- |
- |
- |
| Uygulama |
- |
- |
- |
| Ödev |
- |
- |
- |
| Proje |
1 |
5 |
5 |
| Sunum / Sözlü Sınav |
1 |
5 |
5 |
| Alan Çalışması |
- |
- |
- |
| Staj |
- |
- |
- |
| Kurul |
- |
- |
- |
| Kısa Sınav (Quiz) Hazırlık |
5 |
3 |
15 |
| Ara Sınav Hazırlık |
1 |
17 |
17 |
| Final |
1 |
2 |
2 |
| Final Hazırlık |
1 |
20 |
20 |
| Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi (Ön Çalışma, Pekiştirme vb.) |
12 |
6 |
72 |
| Toplam İş Yükü | | |
178 |
| Toplam İş Yükü / 30 | | |
178 / 30 |
| | |
5.933333 |
| Dersin AKTS Kredisi | | |
6 |
|
Program Çıktısı
**
|
| 1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
6 |
7 |
8 |
9 |
10 |
11 |
|
Ders Çıktısı
|
|---|
| 1 |
A, C, B, D
|
|
A, B
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 2 |
D, C, B, A
|
|
B, A
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 3 |
D, A, C, B
|
|
B, A
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 4 |
B, A, D, C
|
|
B, A
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 5 |
B, A, D, C
|
|
B, A
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 6 |
|
|
|
|
|
A
|
|
|
|
|
|