BMM506

Mühendislik Fakültesi \ Biyomedikal Mühendisliği

3

6

Seçmeli

Türkçe

-

Biyomedikal Mühendisliği Bölümü

BMM 506 dersi öğrencilere sayısal çözümler ve gerekli algoritmalar ve kavramlar hakkında genel bilgi verir. Bu ders kapsamında difüzyon, biyoenformatik, moleküler dinamik, homoloji modellemesi gibi güncel programlar hakkında uygulamalı bilgiler verilmektedir.

• Advanced Engineering Mathematics, P. V. O'Neil, PWS Publishing Company, 2002.
• Numerical Solution of Partial Differential Equations: An Introduction, K. W. Morton and D. F. Mayers, Cambridge University Press, 2005.
• An Introduction to Numerical Analysis, E. Suli and D. Mayers, Cambridge University Press, 2003.
• Güncel Makaleler

Bu dersin amaçları genel olarak sayısal yöntemler ve algoritmalar hakkında bilgi verilerek, difüzyon, biyoenformatik, moleküler dinamik, homoloji modellemesi gibi güncel programları kullanabilme ve çıktıları yorumlama becerisi kazandırmaktır.

1. Sayısal yöntemler hakkında genel bilgiye sahip olunması
2. Başlangıç-sınır-değer problemlerinin sayısal çözümü için sonlu fark yöntemlerinin kullanılması
3. Moleküler dinamik uygulama alanları hakkında bilgi sahibi olunması
4. Biyoenformatik uygulama alanları hakkında genel bilgi sahibi olunması
5. Protein yapı tahmini için mühendislik ve matematiksel yöntemleri uygulama becerisi kazanılması.

1. Hafta: Nümerik Analiz Metotlarına Giriş
2. Hafta: Fark Denklemlerinin Oluşturulup Kesikli Hale Getirilmesi
3. Hafta: Fark Denklemlerinin Nümerik Metotlarla Çözülmesi
4. Hafta: Biyoenformatiğe Giriş
5. Hafta: Biyoenformatik Metotlarını Uygulamaları
6. Hafta: Bilgisayarlı Moleküler Etkileşiml Hesaplamaları
7. Hafta: Moleküler Dinamiğe Giriş
8. Hafta: Moleküler Dinamik Uygulamaları
9. Hafta: Protein Yapı Tahmini
10. Hafta: Homoloji Modellemesi ve Uygulamaları
11. Hafta: Homoloji Modellemesi ve Uygulamaları
12. Hafta: Moleküler Kenetlenme

• Ara Sınavlar % 40
• Final % 40
• Kısa Sınav % 20